密码子分析工具

密码子使用频率列表

快速查询常见物种密码子使用频率表,包括大肠杆菌、酿酒酵母、草地贪夜蛾、人HEK细胞、黑线仓鼠CHO细胞等

稀有密码子分析

分析序列中的稀有密码子并以图表形式直观展示在结果中,同时也会分析基因对宿主细胞的密码子适应指数CAI

GC含量计算

GC含量又称为G+C比值或GC比值,在序列中,鸟嘌呤(G)和胞嘧啶(C)所占的比率称为GC含量。

密码子适应指数分析

输入序列,计算目的基因在宿主细胞的CAI(密码子适应指数)

遗传密码表及差异对照

展示常见的遗传密码子对照表并提供两个遗传密码子表之间的差异对照

密码子使用频率计算

输入序列,计算密码子使用频率,得到指定序列的密码子使用频率表

序列分析工具

信号肽分析

输入序列,对序列中是否存在信号肽及信号肽位置进行分析

跨膜区分析

输入序列,对序列中是否存在跨膜区及跨膜区位置进行预测。

疏水性分析工具

对序列进行疏水性分析

抗原决定簇预测(v1)

此工具可以展示五种蛋白抗原决定簇预测算法的数据,帮助进行抗原多肽的设计。

抗原决定簇预测(v2)

采用与BepiPred-2.0相同的算法,访问速度比BepiPred-2.0快,操作更方便。1-2分钟可得到分析结果

氨基酸属性表及分子量分析

20种氨基酸的属性及分子量对比列表

基因序列格式化工具

3s内将基因序列转化为标准格式

蛋白序列格式化工具

3s内将蛋白序列转化为标准格式

多肽或蛋白序列属性计算器

快速得到多肽/蛋白的长度、分子量、等电点等属性

基因重复序列计算器

分析得到序列中的重复序列,及重复序列的长度、位置、退火温度等信息