细胞培养中可以使用许多方法对交叉污染进行鉴定，如同功酶分析、染色体组分型、人淋巴细胞抗原(HLA)分型和扩增片段长度多态性(AFLP)的特征分析、STR分析等。
近年来，大量研究表明STR基因分型方法是进行细胞交叉污染和性质鉴定的最有效和准确的方法之一，STR基因分型已经被ATCC等细胞库组织作为金标准应用于细胞系鉴定(ANSI/ATCC ASN-0002-2011)。美国的ATCC细胞库、德国的DSMZ细胞库以及日本的JCRB细胞库等为STR分型提供了各细胞株的数据供比对。
STR基因位点由长度为3~7个碱基对的短串联重复序列组成，这些重复序列广泛存在于人类基因组中，可作为高度多态性标记，被称为细胞的DNA指纹，其可通过一定的计算方法，即可根据所得的STR分型结果与专业的细胞STR数据库比对从而推算出样品所属的细胞系或可能的交叉污染的细胞系名称。
STR鉴定的试验流程
细胞DNA提取——多色荧光体系复合扩增——DNA片段分离荧光信号检测——数据分析得到的基因分析和图谱——与数据库对比和结果分析——出具数据报告
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